Block B – обновление программного обеспечения бортовых систем.
Block С – оснащение кластерными бомбами CBU-87/89/97.
Block D – оснащение буксируемой волоконно-оптической системой ложных целей AN/ALE-50, коммуникационной системой AN/ARC-210, добавление в авионику поддержки GPS навигации, оснащение высокоточными корректируемыми бомбами GBU-31 Joint Direct Attack Munition (JDAM).
Block E – модернизация информационных систем для поддержки более широкой номенклатуры вооружений, интеграция с вооружением типа — Wind Corrected Munition Dispenser (WCMD), Joint Stand-Off Weapon (JSOW), и Joint Air-to-Surface Standoff Missile (JASSM).
Block F – оснащение средством радиоэлектронной борьбы AN/ALQ-214 IDECM и системой предупреждения об облучении AN/ALR-56M.
Cockpit Upgrade Program (CUP) – программа по обновлению кабины пилотов. В рамках программы на B-1B были установлены ЖКД и прочие более продвинутые электронные устройства.
Link-16 – программа по оснащению самолётов каналом связи Link-16, позволяющим автоматически обмениваться данными с другими самолётами в режиме реального времени.
JDAM (Joint Direct Attack Munition) – бомбы, оборудованные комплектом JDAM, направляются к цели интегрированной инерциальной системой наведения в паре с GPS-приёмником улучшенной точности, обеспечивая им объявленную дальность действия в 28 км от точки сброса.
JSOW (Joint Stand-Off Weapon) – тактическая планирующая управляемая авиационная бомба, предназначенная для поражения широкого спектра стационарных и подвижных целей за пределами зон ПВО, принцип “пустил-забыл”
JASSM (Joint Air-to-Surface Standoff Missile) – высокоточная крылатая ракета класса “воздух — поверхность”, для поражения важных, высокозащищённых стационарных и перемещаемых целей (квазистационарных), в любых метеоусловиях и в любое время суток, с дистанций вне зоны действия средств ПВО противника.
При проведении модернизации B-1B, ВВС США планирует сохранить данные самолеты на вооружении, до 2038 года.
В версии бомбардировщика B-1B реализована концепция маловысотного прорыва #ПВО посредством полёта на сверхмалых высотах с огибанием рельефа местности и применением технологий радиолокационной малозаметности.